DES MILLIERS D’ORDINATEURS SOLLICITÉS À TRAVERS LE MONDE POUR SOUTENIR UN PROJET DE RECHERCHE SUR LE CANCER
 Des milliers d’ordinateurs sollicités à travers le monde pour soutenir un projet de recherche sur le cancer
Mutualiser la puissance de calcul inutilisée de tous les PC des adhérents et créer un vaste réseau mondial au service de la recherche, telle est la mission de la World community grid. Déjà porteuse de cinq programmes de recherche depuis sa création en 2003, l’association canadienne vient de lancer un nouveau projet, le "Help Conquer cancer", littéralement "Aidez à vaincre le cancer".Initialisé par des chercheurs du Hauptmann-Woodward medical research institute (HWI) de la ville de Wood Buffalo au Canada, ce programme vise à améliorer l’identification par cristallographie des protéines impliquées dans la cancérogénèse. La World community grid propose d’apporter la puissance de calcul phénoménale nécessaire à l’étalonnage de la méthode en utilisant le principe de l’informatique distribuée. Après avoir téléchargé sur le site www.worldcommunitygrid.org et installé un petit programme sur son ordinateur, n’importe quel volontaire du monde entier peut mettre à disposition, à travers internet, la capacité de calcul de sa machine.La création d’un vaste réseau de plusieurs milliers d’ordinateurs constitue une aubaine pour les chercheurs, qui surpasse largement la puissance d’une poignée de supercalculateurs. Grâce au système, le temps de recherche passe de plusieurs années à quelques mois. Et la technique est d’autant plus intéressante qu’elle est très peu coûteuse.86 MILLIONS DE CLICHES A ANALYSERL’objectif des chercheurs du HWI est de déterminer les meilleures conditions de cristallisation des protéines qui nécessite de nombreux essais, surtout dans le cas des protéines impliquées dans la cancérogénèse, généralement très complexes.Pour cela, les scientifiques utilisent un robot pour tester les milliers de combinaisons de traitement possible induisant la cristallisation d’une protéine. La qualité du cristal obtenu est ensuite évaluée mathématiquement à travers des clichés photographiques réalisés pour chaque essai par le robot lui même. Pour une seule protéine, ce sont près de 10.000 clichés à analyser. Les chercheurs ont ainsi accumulé depuis le début de leurs travaux plus de 86 millions de photos pour l’étude de 9.400 protéines, soit près de 100.000 années de travail d’analyse avec un seul ordinateur. C’est une fois que la meilleure méthode de cristallisation est identifiée que les chercheurs peuvent ensuite étudier le cristal par rayon X et déterminer la structure spatiale de la protéine.En utilisant le principe de l’informatique distribuée, des résultats devraient être obtenus en quelques années, tout dépend du nombre d’ordinateurs mis à disposition par les internautes. En mars 2007, un réseau informatique a battu tous les records en mutualisant près de 670.000 ordinateurs et autres outils de calcul pour participer à un programme de recherche américain informatique sur la compréhension des maladies d’Alzheimer et de Parkinson./vr/ajr
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9 novembre 2007
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